重組MIX是一款簡單、快速、高效的多片段DNA定向克隆產(chǎn)品,本試劑盒可以將PCR產(chǎn)物定向克隆至任意載體的任意位點(diǎn)。將載體在克隆位點(diǎn)進(jìn)行線性化,并在插入片段PCR引物5’端引入線性化克隆載體末端序列,使得插入片段PCR產(chǎn)物5’和3’最末端分別帶有和線性化克隆載體兩末端對應(yīng)的完全一致的序列(20 bp~40 bp)。將這種兩端帶有載體末端序列的PCR產(chǎn)物和線性化克隆載體按一定比例混合,在重組酶的催化下,僅需反應(yīng)15-60 min即可進(jìn)行轉(zhuǎn)化,完成定向克隆??寺£栃月士蛇_(dá)90%以上。
試劑盒中2×重組MIX預(yù)混了重組酶和重組反應(yīng)所需緩沖液,并添加了特殊成分,可顯著提高重組克隆效率,可以一次實(shí)現(xiàn)多至6個片段的順序拼接克隆。
應(yīng)用:
? 多片段克隆到目標(biāo)載體
? 多片段組裝后作為PCR或RCA的模板
產(chǎn)品特點(diǎn):
? 簡單高效的定向無縫克隆
? 靈活的序列設(shè)計,無需考慮酶切位點(diǎn)
? 無需PCR純化步驟
? 可同時進(jìn)行最多6個DNA片段的組裝
質(zhì)量控制檢測 :
使用Positive control組裝五個DNA片段,涂布于CI抗性平板上,最終用菌落PCR或質(zhì)粒酶切驗證,陽性克隆達(dá)到87.5%及以上。
使用說明
1、反應(yīng)體系
冰上配制如下反應(yīng)體系。
2×重組MIX 10 μL
線性化克隆載體 A ng
插入片度(PCR擴(kuò)增產(chǎn)物 ) B ng
ddH2O Up to 20μL
注:如果不慎將液體粘在管壁,可通過短暫離心使其沉入管底;
重組Mix重組反應(yīng)體系最適DNA使用量為每線性化片段0.03pmol。該摩爾數(shù)對應(yīng)的DNA質(zhì)量可由以下公式計算獲得:片段添加量(ng)= 0.02×片段堿基對數(shù)(bp)(對應(yīng)的片段濃度為0.03 pmol)。
2、重組反應(yīng)
(1)在冰上解凍2×重組Mix,顛倒混勻。
(2)在無菌管中加入載體和片段(按上述要求),用無菌水補(bǔ)足到10μL,最后加入10 μL 2×重組Mix,用移液器輕輕吸打混勻避免氣泡產(chǎn)生。
(3)50℃恒溫反應(yīng)15-50min,2-3個片段15min反應(yīng)即可,4-6個片段需反應(yīng)60min,在冰上放置3-5min。
3、轉(zhuǎn)化
(1)取化學(xué)轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞于冰上解凍。
(2)取上述反應(yīng)液10 μL加入到感受態(tài)細(xì)胞中充分混勻。冰浴10min。
(3)將離心管置于42℃水浴鍋中熱激90s,然后迅速放回冰上,使細(xì)胞冷卻2~3min。
(4)向離心管中加入已預(yù)熱的無菌LB(或SOC)培養(yǎng)液600μL,37℃恒溫振蕩培養(yǎng)45~60min。
(5)短暫離心棄上清,吸取100 μL的新鮮LB培養(yǎng)基重新懸浮,將菌液均勻涂布在含有適當(dāng)抗生素的平板上。將平板倒置,于37℃過夜培養(yǎng)。
4、 克隆鑒定
菌落PCR。用無菌的槍頭或牙簽將單個菌落挑至20~50μL LB 培養(yǎng)基中混勻,直接取1μL作為PCR模板,使用2×Taq DNA Polymerase Master進(jìn)性菌落PCR實(shí)驗。
注意事項
? 為達(dá)到最優(yōu)的重組效果,請保證體系中PCR片段和載體的質(zhì)量,建議DNA樣品A260/280>1.8,濃度>40ng/ul。
? 多片段重組時,相鄰兩個DNA片段有互不相同的20-40bp同源序列,確保定向組裝。同源序列的長度由片段數(shù)目和長度決定,多片段重組建議設(shè)計40bp同源序列。同源序列需要避免重復(fù)序列、復(fù)雜二級結(jié)構(gòu)以及高低GC區(qū)域。
? 當(dāng)?shù)玫降腜CR產(chǎn)物條帶單一時,可無需純化,產(chǎn)物可直接用于重組,注意產(chǎn)物添加量不可超過重組體系的1/10。
? EDTA等金屬離子螯合劑對該產(chǎn)品有抑制作用,必須保證反應(yīng)體系中不含該類螯合劑。